分离制的优点：(1)有利于整个公共行政系统的资源整合，团结协作，统筹兼顾。(2)有利于整个公共行政系统的统一领导和统一指挥。(3)有利于专业化管理，强调部门职能。(4)有分有合，集中集权与分权的优点。
缺陷：(1)多元领导有可能造成下级无所适从。(2)人与事分离，不利于对公务员的领导和使用。(3)难于协调，容易出现文山会海。